Võimas 3D kujutusseade meetod elektronide mikroskoobi abil. Normaallambiga elektronide, põhimõtteliselt imaging bioloogiliste objektid on väga sarnane pildindus, millel on kerge. Elektronide kompuutertomograafia pildindus, mille energiaväärtusega (tavaliselt 100–400 kV) ühtne elektronkiire kasutatakse valgustuse allikas ja keskendamine läätsed on magnetilised läätsed. Juhtum elektronkiire suhtleb näidise ja viib pildid on moodustunud eesmärgi läätsed näidise sisemise struktuuri kohta. Kujutised on veelgi devalveerumise ja salvestatud foto filmide või tasuta-haagis-seade (CCD) kaamerad 2D projektsioon kujutistena. 2D projektsioon pildid sisaldavad teavet läbi onto tasapind ahendatud näidise. Traditsiooniliselt on seda meetodit on edukalt kasutatud rakulise ultrastructure uurida ja analüüsida immunolabeling ultrathin osade bioloogilise isendite lahendused, mis on 100 korda parem kui valgusmikroskoopia saavutamise suunas. Siiski kui paksem isendite analüüsitakse tingitud elektronkiire, põhifookus suur sügavus 2D projektsioon pilte sisaldavad funktsioone hägustab palju teavet elektronkiire suunas tόhjaks. Siiski, kuna need 2D projektsioon pildid sisaldavad kõik kõrgused teabe näidise, seega on võimalik ühendades erinevate vaadete projektsioon kujutiste saamiseks 3D-objekti sisemise struktuuri kujutusseade meetodil nagu elektronide kompuutertomograafia (ET) 2D projektsioon kujutiste kogumi.